O Taylor UUCP permite uma sintonia fina, ricamente detalhada na funcionalidade de transferência de arquivos. Pode-se, por exemplo, desabilitar a transferência de e para um sistema em particular. Basta configurar o parâmetro request para no e o sistema remoto não será capaz de receber ou enviar arquivos para o sistema local. Similarmente, pode-se proibir os usuários de transferirem arquivos de ou para um sistema, configurando-se o parâmetro transfer para no. Por padrão, usuários dos sistemas local ou remoto tem permissão para receber ou enviar arquivos.
Adicionalmente pode-se configurar os diretórios para e de onde os arquivos podem ser copiados. Normalmente, deseja-se restringir os acessos de sistemas remotos a uma única árvore de diretórios e permitir que os usuários possam enviar arquivos a partir de seus diretórios pessoais. Comumente, usuários remotos terão permissão para receber arquivos somente dos diretórios públicos do UUCP, denominado publicspool. Este é o local tradicional para tornar arquivos públicos, muito similar ao servidores FTP da Internet. É comumente referenciado através do uso do caractere til.
O Taylor UUCP provê quatro comandos diferentes para configuração dos diretórios de envio e recepção de arquivos. Eles são definidos através dos parâmetros local-send, que especifica a lista de diretórios que os usuários podem usar para o envio de arquivos, local-receive que define a lista de diretórios usados para a recepção de arquivos, remote-send e remote-receive que possuem funções similares em sistemas remotos. Considerando-se o seguinte exemplo:
O comando localsend permite aos usuários do sistema local o envio de qualquer arquivo contido no diretório home ou no diretório público UUCP para o sistema parintins. O comando localreceive permite que os arquivos recebidos sejam armazenados nos diretórios pessoais sob home e no diretório recebidos sob o diretório público, normalmente denominado uucppublic. A diretiva remotesend permite que os usuários de parintins requisitem arquivos a partir do diretório /var/spool/uucppublic, exceto dos diretórios incoming e receive. Isso é sinalizado ao programa uucico através de um ponto de exclamação (!) antes do nome do diretório. Finalmente a última linha permite que os usuários de parintins transfiram quaisquer arquivos para o diretório recebidos.
Um dos maiores problemas com a transferência de arquivos através do UUCP reside na necessidade de permissão de gravação para qualquer usuário nos diretórios de destino para que a transferência possa ser efetuada. Isso pode permitir que alguns usuários montem ``armadilhas'' para os demais, etc. De qualquer forma, não há forma de contornar este problema, sem desabilitar todas as transferências de arquivos via UUCP.