As tarefas básicas do UUCP são copiar arquivos de um sistema para outro e requisitar a execução de certos comandos em máquinas remotas. Obviamente, um administrador deseja controlar os direitos definidos para outros sistemas, afinal de contas permitir que eles executem qualquer comando no sistema local pode não ser uma boa idéia.
Os únicos comandos que podem ser executados por sistemas remotos na máquina local, segundo o padrão do Taylor UUCP, são rmail e rnews, os quais são comumente usados para troca de mensagem e notícias Usenet sobre UUCP. O padrão do caminho de pesquisa usado pelo programa uuxqt é definido em tempo de compilação, mas usualmente contem os diretórios /bin, /usr/bin e /usr/local/bin. Para mudar o conjunto de comandos para um sistema em particular, pode-se usar o parâmetro commands no arquivo sys. Similarmente, para mudar o caminho de pesquisa a ser usado pode-se usar o comando command-path. Por exemplo, pode-se desejar que o sistema parintins execute o comando rsmtp além dos comandos rmail e rnews:12.15