Isto depende do que você está usando como a placa de conexão. Se esta tem uma ROM BIOS com o código que pode inicializar do endereço 5 ou 6, então sim, você pode incializar do dispositivo SCSI ZIP. Você não pode inicializar de um dispositivo de porta paralela.
Se você tem o DOS em seu disco principal e quer inicializar o Linux de um disco ZIP, pode fazer isso usando o carregador LOADLIN. A cópia do seu kernel deve estar em algum lugar no disco do DOS, mas o resto do seu sistema Linux pode estar no ZIP. Certifique-se de que o kernel que você usa possui os controladores integrados corretos.
Tão ciente como eu esteja, não existe instalação de disquetes de inicialização para qualquer distribuição que contenha o controlador paralelo ZIP.