Sistemas de arquivos danificados são problemas muito comuns que podem ser tratados pelo disco de resgate do Linux. Estes problemas normalmente surgem após o desligamento do sistema sem os procedimentos adequados, quando por exemplo há uma falha de energia. Caso os problemas sejam muito sérios, é possível que sequer o sistema de arquivos raiz possa ser montado, sendo que o sistema apresentará a mensagem ``kernel panic'' e a inicialização não prosseguirá. Nestes casos a única chance de recuperar os dados será acessar o sistema a partir da inicialização do sistema via um método externo ao equipamento.
O disco de resgate do Conectiva Linux contém o utilitário e2fsck que executa uma verificação em sistemas de arquivos nativos do Linux. Adicionalmente está disponível ainda o comando dumpe2fs o qual exibe informações sobre o superbloco e grupos de blocos para o sistema de arquivos presente no dispositivo.