Quando o sistema não pode ser carregado, como por exemplo em alguma má configuração do LILO onde os demais dados do sistema local permanecem intactos, uma cópia da inicialização é a melhor solução.
Logo após a instalação ou de mudanças na configuração deve-se gerar um disco de inicialização adequado às configurações da máquina local através do utilitário mkbootdisk.
O mkbootdisk cria um disquete de inicialização personalizado para o sistema local. O disquete contém todos os elementos necessários para o processo de inicialização e inclui um disco em memória inicial que carrega os programas de controle de dispositivos SCSI necessários ao sistema. O disquete criado busca o sistema de arquivos raiz no dispositivo configurado no arquivo /etc/fstab. O único argumento requerido é a versão do kernel a ser incluído no kernel.
O disquete de inicialização resultante pode ser usado a partir de um sistema de arquivos raiz em disquete através do comando rescue na linha de comando de inicialização do sistema: lilo: ao invés de ser carregada a imagem de inicialização padrão.
Quando o sistema local utiliza módulos para carga de dispositivos SCSI ou outros para acessar o sistema de arquivos raiz é necessário que este módulos sejam carregados antes da inicialização do sistema. Para criar uma imagem personalizada do disco inicial em memória deve-se utilizar o programa mkinitrd.
O utilitário mkinitrd cria uma imagem do sistema de arquivos adequada ao uso no disco inicial em memória Linux (initrd).Tais imagens são comumente utilizadas para a pré-carga de módulos de dispositivos em bloco (tais como SCSI ou RAID) os quais são necessários para o acesso ao sistema de arquivos raiz. mkinitrd automaticamente carrega todos as entradas de adaptadores_scsi encontradas no arquivo /etc/conf.modules, o que facilita a construção e o uso kernels que utilizem dispositivos SCSI.
Quaisquer opções de módulos especificadas em /etc/conf.modules serão repassadas quando eles forem carregados no disco inicial em memória.